Ян Антонышев родился в 1965 году в Санкт-Петербурге.
В 1981 году вместе с друзьями основал группу «Старый Город». Главный девиз коллектива – запечатлевать историческую старину Петербурга и других городов мира, их непарадную, нетуристическую сторону.
В 1985 году окончил отделение реставрации Художественного училища имени В. Серова (теперь, имени Н. Рериха), получил мастерскую от Союза Художников.
Участник выставок с 1990, в том числе в России, Италии, Германии, Франции.
Работы выставлены в Новой Пинакотеке в Мюнхене, находятся в собраниях Министерства Культуры РФ, музеях и галереях России, а также в частных собраниях России, Швеции, Германии, Шотландии, Франции, Южной Кореи, США, Италии, Норвегии, Канады и др.
Работает в области фигуративной графики, в авторской пастельной технике: использует пастель, картон, обработанный особым образом, и реставраторский скальпель – для проработки деталей.
Несмотря на то, что Ян как художник формировался в среде неформальных ленинградских тусовок 1980-х (Сайгон, рок-клуб и т.д.), в его работах больше всего заметно влияние традиционной академической культуры с ее вечными сюжетами и символами.
Главный герой работ Яна – Петербург, который становится его альтер-эго и предстает в его работах живым существом.
У художника есть своя система символов и знаков: красно-белая оградительная ленточка становится оберегом; рыбы – отсылкой одновременно к библейским сюжетам и к личной жизни; трехцветный мячик – неизменный атрибут работ Яна – отсылает к фильмам Андрея Тарковского, который оказал большое влияние на художника. В коллекции Тарковских хранится несколько работ Антонышева.
Ян – активный участник градозащитного движения Петербурга, призванного защитить исторические здания от уничтожения.